La spécialisation Ecologie offre une formation approfondie, scientifiquement fondée et orientée vers la recherche dans les domaines de l'écologie, de l'évolution et de la diversité des microorganismes des trois domaines de la vie. Les étudiants acquièrent des connaissances sur l'évolution et le fonctionnement/la signification de la biodiversité et apprennent les techniques d'investigation des mécanismes permettant d'identifier et d'expliquer les modèles de distribution spatiotemporels des communautés et des populations symbiotiques. La formation utilise des technologies de pointe pour aborder les questions écologiques et leur analyse à différents niveaux.